แม้จะอ้างว่าที่ทำไปเพื่อลดเงื่อนไขและสร้างแรงจูงใจให้ต่างชาตินำเงินเข้ามาลงทุนในโครงการระดับยักษ์มากยิ่งขึ้นก็ตาม แต่รัฐบาลสามารถรับประกันได้หรือไม่ว่าการประมูลที่เกิดขึ้นนี้จะเป็นไปอย่างโปร่งใสชอบธรรมอย่างแท้จริง โดยเฉพาะอย่างยิ่งในประเด็นต่าง ๆ ดังนี้

ความไม่โปร่งใสในการประมูลที่ไม่มีระเบียบแบบแผน เนื่องจากเมื่อไม่ได้ระบุให้ชัดเจนถึงระเบียบแบบแผนในการประมูล สำนักงานตรวจเงินแผ่นดินย่อมมีความยากลำบากในการตรวจสอบความโปร่งใสของการประมูล รวมทั้งเทคโนโลยีที่ล้ำสมัยในโครงการต่าง ๆ  อาจทำให้หน่วยงานตรวจสอบของไทยไม่สามารถจับได้ไล่ทันในกลโกงต่าง ๆ ที่อาจซ่อนอยู่

ความไม่โปร่งใสในการใช้ดุลพินิจในการเลือกผู้ชนะการประมูล เนื่องจากโดยปกติแล้ว การประมูลงานใด ๆ ก็ตามต้องมีการกำหนดทีโออาร์หรือข้อกำหนดของโครงการเสียก่อน แต่สำหรับโครงการนี้รัฐบาลไม่ได้กำหนดทีโออาร์ แต่ให้บริษัทต่างชาติเข้ามาร่วมเสนอแผนการดำเนินโครงการเพื่อให้รัฐบาลเลือก เป็นที่น่าสงสัยว่าหากแผนโครงการของแต่ละบริษัทมีข้อดีข้อเสียที่แตกต่างกัน รัฐบาลจะใช้เกณฑ์อะไรเลือกแผนของผู้เสนอโครงการ นอกจากใช้ดุลพินิจในการเลือก จำนวนเงินที่มากมายมหาศาลในการลงทุนโครงการขนาดใหญ่ หากใช้เพียงดุลพินิจในการคัดเลือกดูจะไม่เป็นธรรมต่อประชาชนผู้เป็นเจ้าของเงินนัก

ความไม่โปร่งใสในการให้ชี้แจงข้อสงสัยได้ด้วยวาจา การที่รัฐบาลเปิดช่องทางในการซักถามข้อสงสัยจากผู้ยื่นแบบเข้าร่วมประมูล โดยสามารถเรียกมาชี้แจงเพื่อตอบข้อสงสัยได้ด้วยวาจา ไม่ต้องตอบเป็นเอกสารเหมือนในอดีต แม้จะทำให้เกิดความรวดเร็วและอาจทำให้เกิดความเข้าใจที่ชัดเจนมากกว่าการตอบเป็นเอกสาร แต่ในอีกด้านหนึ่ง อาจเป็นการเปิดช่องให้เกิดการเจรจาต่อรองแลกเปลี่ยนผลประโยชน์กันอย่างไม่โปร่งใส โดยปราศจากหลักฐานการชี้แจงที่เป็นลายลักษณ์อักษร